Η Εγνατία Οδός θα αποκτήσει 18 σταθμούς διοδίων συνολικά, που θα τοποθετηθούν ανά τακτά χιλιομετρικά διαστήματα, καλύπτοντας και τα 670 χλμ. του μήκους της.