Η ιστορία του Audi S3 πρώτης γενιάς ξεκίνησε το 1999, δύο χρόνια αργότερα ήρθε μία αισθητική αναβάθμιση με ελαφρώς ισχυρότερο κινητήρα και η παραγωγή ολοκληρώθηκε στα μέσα του 2003. Όλα διατέθηκαν αποκλειστικά σε τρίθυρη έκδοση και βασίζονταν στην πλατφόρμα της τέταρτης γενιάς του Volkswagen Golf, ενώ αρκετά θετική είναι η ύπαρξη ανάρτησης πολλαπλών συνδέσμων στον πίσω άξονα. Από την πρώτη κιόλας γενιά ήταν διαθέσιμο το πλήρως απενεργοποιούμενο σύστημα ευστάθειας στο πακέτο του βασικού εξοπλισμού. Εξωτερικά, διαφοροποιείται από τις «απλές» εκδόσεις λόγω της ύπαρξης ανασχεδιασμένων προφυλακτήρων, πιο φουσκωμένων θόλων και ζαντών αλουμινίου μεγέθους 17 ιντσών. Στο πίσω μέρος, χαρακτηριστική είναι η χρωμιωμένη διπλή απόληξη του συστήματος εξάτμισης και η διακριτική αεροτομή. Στο εσωτερικό συνεχίζεται το «sportive» κλίμα, με τα bucket ημιδερμάτινα καθίσματα της Recaro να φέρουν προαιρετικά δέρμα τύπου alcantara στη μεγαλύτερη επιφάνειά τους.
Στο εσωτερικό συνεχίζεται το «sportive» κλίμα, με τα bucket ημιδερμάτινα καθίσματα της Recaro να φέρουν προαιρετικά δέρμα τύπου alcantara στη μεγαλύτερη επιφάνειά τους.
